Các flavivirus do muỗi truyền bao gồm một RNA bộ gen có ý nghĩa tích cực được bao quanh bởi các vùng chưa được dịch mã (UTR). Có một bảng gồm các cấu trúc RNA rất phức tạp trong UTR với các chức năng quan trọng. Ví dụ, RNA kháng Xrn1 (xrRNA) tạm dừng quá trình tiêu hóa Xrn1, dẫn đến việc sản xuất RNA flavivirus cấp gen (sfRNA). Các đoạn lặp trực tiếp ngắn được bảo tồn (DR), còn được gọi là các trình tự được bảo tồn (CS) và các trình tự được bảo tồn lặp đi lặp lại (RCS), đã được xác định là nằm trong số các phần tử RNA định vị ở phía dưới của xrRNA, nhưng chức năng sinh học của chúng vẫn chưa được biết. Trong nghiên cứu này, chúng tôi đã tiết lộ rằng các DR cụ thể có liên quan đến việc sản xuất các sfRNA cụ thể ở cả tế bào động vật có vú và muỗi. Các thử nghiệm sinh hóa và tu sửa cấu trúc chứng minh rằng các cặp bazơ trong gốc của các DR này kiểm soát sự hình thành sfRNA bằng cách duy trì ái lực liên kết của các xrRNA tương ứng với Xrn1. Trên cơ sở những phát hiện này, chúng tôi đề xuất rằng các DR hoạt động giống như một giá đỡ giữ phức hợp Xrn1-xrRNA để hình thành sfRNA.TẦM QUAN TRỌNG Flavivirus bao gồm nhiều tác nhân gây bệnh quan trọng ở người. Việc sản xuất RNA flavivirus subgenomic (sfRNA) rất quan trọng đối với khả năng gây bệnh của virus như là một đặc điểm chung của flaviviruses. Các sfRNA được hình thành thông qua sự phân hủy không hoàn toàn của RNA bộ gen của virus bởi 5'-3' exoribonuclease Xrn1 của tế bào chất bị dừng lại ở các cấu trúc RNA (xrRNA) kháng Xrn1 trong 3'-UTR. Các 3'-UTR của bộ gen flavivirus cũng chứa các đoạn lặp trực tiếp ngắn (DR) riêng biệt, chẳng hạn như RCS3, CS3, RCS2 và CS2. Tuy nhiên, các chức năng sinh học của các trình tự DR sơ cấp cổ xưa này vẫn chưa được biết rõ. Ở đây, chúng tôi thấy rằng các trình tự DR có liên quan đến sự hình thành sfRNA và độc lực của virus, đồng thời cung cấp các mục tiêu mới cho thiết kế hợp lý của vắc-xin flavivirus sống giảm độc lực.
